Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK0

GRID1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID1Q9ULK0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRID1Q9ULK0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms