Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM4Q9UKN5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM4Q9UKN5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM4Q9UKN5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM4Q9UKN5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM4Q9UKN5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM4Q9UKN5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM4Q9UKN5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM4Q9UKN5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM4Q9UKN5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM4Q9UKN5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM4Q9UKN5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM4Q9UKN5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM4Q9UKN5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM4Q9UKN5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM4Q9UKN5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM4Q9UKN5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM4Q9UKN5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM4Q9UKN5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM4Q9UKN5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM4Q9UKN5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM4Q9UKN5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM4Q9UKN5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM4Q9UKN5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM4Q9UKN5 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM4Q9UKN5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM4Q9UKN5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM4Q9UKN5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM4Q9UKN5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM4Q9UKN5 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM4Q9UKN5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM4Q9UKN5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM4Q9UKN5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM4Q9UKN5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM4Q9UKN5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM4Q9UKN5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM4Q9UKN5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM4Q9UKN5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM4Q9UKN5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM4Q9UKN5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM4Q9UKN5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM4Q9UKN5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM4Q9UKN5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM4Q9UKN5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM4Q9UKN5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM4Q9UKN5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM4Q9UKN5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM4Q9UKN5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM4Q9UKN5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM4Q9UKN5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM4Q9UKN5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM4Q9UKN5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms