Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGJ1

TUBGCP4, Gamma-tubulin complex component 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP4Q9UGJ1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBGCP4Q9UGJ1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBGCP4Q9UGJ1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBGCP4Q9UGJ1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBGCP4Q9UGJ1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBGCP4Q9UGJ1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBGCP4Q9UGJ1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBGCP4Q9UGJ1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBGCP4Q9UGJ1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBGCP4Q9UGJ1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBGCP4Q9UGJ1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBGCP4Q9UGJ1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBGCP4Q9UGJ1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBGCP4Q9UGJ1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBGCP4Q9UGJ1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBGCP4Q9UGJ1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBGCP4Q9UGJ1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBGCP4Q9UGJ1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBGCP4Q9UGJ1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBGCP4Q9UGJ1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBGCP4Q9UGJ1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBGCP4Q9UGJ1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBGCP4Q9UGJ1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TUBGCP4Q9UGJ1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBGCP4Q9UGJ1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBGCP4Q9UGJ1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBGCP4Q9UGJ1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBGCP4Q9UGJ1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBGCP4Q9UGJ1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBGCP4Q9UGJ1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBGCP4Q9UGJ1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBGCP4Q9UGJ1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBGCP4Q9UGJ1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBGCP4Q9UGJ1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBGCP4Q9UGJ1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBGCP4Q9UGJ1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBGCP4Q9UGJ1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBGCP4Q9UGJ1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBGCP4Q9UGJ1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBGCP4Q9UGJ1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBGCP4Q9UGJ1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBGCP4Q9UGJ1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBGCP4Q9UGJ1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBGCP4Q9UGJ1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBGCP4Q9UGJ1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBGCP4Q9UGJ1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBGCP4Q9UGJ1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBGCP4Q9UGJ1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBGCP4Q9UGJ1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBGCP4Q9UGJ1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBGCP4Q9UGJ1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBGCP4Q9UGJ1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBGCP4Q9UGJ1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBGCP4Q9UGJ1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBGCP4Q9UGJ1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP4Q9UGJ1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP4Q9UGJ1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP4Q9UGJ1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP4Q9UGJ1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP4Q9UGJ1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBGCP4Q9UGJ1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBGCP4Q9UGJ1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBGCP4Q9UGJ1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBGCP4Q9UGJ1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBGCP4Q9UGJ1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBGCP4Q9UGJ1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBGCP4Q9UGJ1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBGCP4Q9UGJ1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBGCP4Q9UGJ1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBGCP4Q9UGJ1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBGCP4Q9UGJ1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms