Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms