Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNTN3Q9P232 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNTN3Q9P232 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTN3Q9P232 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTN3Q9P232 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTN3Q9P232 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTN3Q9P232 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTN3Q9P232 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTN3Q9P232 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTN3Q9P232 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTN3Q9P232 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTN3Q9P232 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTN3Q9P232 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTN3Q9P232 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTN3Q9P232 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTN3Q9P232 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTN3Q9P232 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTN3Q9P232 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTN3Q9P232 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTN3Q9P232 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTN3Q9P232 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTN3Q9P232 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTN3Q9P232 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTN3Q9P232 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTN3Q9P232 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTN3Q9P232 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTN3Q9P232 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTN3Q9P232 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTN3Q9P232 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTN3Q9P232 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTN3Q9P232 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTN3Q9P232 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTN3Q9P232 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTN3Q9P232 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTN3Q9P232 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTN3Q9P232 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTN3Q9P232 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTN3Q9P232 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTN3Q9P232 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTN3Q9P232 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTN3Q9P232 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTN3Q9P232 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTN3Q9P232 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTN3Q9P232 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTN3Q9P232 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms