Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0T7

TMEM9, Transmembrane protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM9Q9P0T7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms