Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

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Length 4,599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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