Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
ARHGEF12Q9NZN5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC34.8■■■■□ 3.16
ARHGEF12Q9NZN5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
ARHGEF12Q9NZN5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
ARHGEF12Q9NZN5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
ARHGEF12Q9NZN5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
ARHGEF12Q9NZN5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
ARHGEF12Q9NZN5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
ARHGEF12Q9NZN5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
ARHGEF12Q9NZN5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
ARHGEF12Q9NZN5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
ARHGEF12Q9NZN5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
ARHGEF12Q9NZN5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
ARHGEF12Q9NZN5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
ARHGEF12Q9NZN5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ARHGEF12Q9NZN5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ARHGEF12Q9NZN5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
ARHGEF12Q9NZN5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
ARHGEF12Q9NZN5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ARHGEF12Q9NZN5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
ARHGEF12Q9NZN5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
ARHGEF12Q9NZN5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
ARHGEF12Q9NZN5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
ARHGEF12Q9NZN5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
ARHGEF12Q9NZN5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
ARHGEF12Q9NZN5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
ARHGEF12Q9NZN5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
ARHGEF12Q9NZN5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
ARHGEF12Q9NZN5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
ARHGEF12Q9NZN5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
ARHGEF12Q9NZN5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
ARHGEF12Q9NZN5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
ARHGEF12Q9NZN5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
ARHGEF12Q9NZN5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
ARHGEF12Q9NZN5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
ARHGEF12Q9NZN5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
ARHGEF12Q9NZN5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
ARHGEF12Q9NZN5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.16
ARHGEF12Q9NZN5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
ARHGEF12Q9NZN5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC34.76■■■■□ 3.16
ARHGEF12Q9NZN5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
ARHGEF12Q9NZN5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
ARHGEF12Q9NZN5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.15
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
ARHGEF12Q9NZN5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
ARHGEF12Q9NZN5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
ARHGEF12Q9NZN5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
ARHGEF12Q9NZN5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
ARHGEF12Q9NZN5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
ARHGEF12Q9NZN5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
ARHGEF12Q9NZN5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
ARHGEF12Q9NZN5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ARHGEF12Q9NZN5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
ARHGEF12Q9NZN5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ARHGEF12Q9NZN5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ARHGEF12Q9NZN5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ARHGEF12Q9NZN5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ARHGEF12Q9NZN5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
ARHGEF12Q9NZN5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ARHGEF12Q9NZN5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
ARHGEF12Q9NZN5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
ARHGEF12Q9NZN5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
ARHGEF12Q9NZN5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
ARHGEF12Q9NZN5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
ARHGEF12Q9NZN5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
ARHGEF12Q9NZN5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
ARHGEF12Q9NZN5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
ARHGEF12Q9NZN5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ARHGEF12Q9NZN5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ARHGEF12Q9NZN5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC34.71■■■■□ 3.15
ARHGEF12Q9NZN5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
ARHGEF12Q9NZN5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ARHGEF12Q9NZN5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ARHGEF12Q9NZN5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
ARHGEF12Q9NZN5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
ARHGEF12Q9NZN5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
ARHGEF12Q9NZN5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC34.7■■■■□ 3.14
ARHGEF12Q9NZN5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
ARHGEF12Q9NZN5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
ARHGEF12Q9NZN5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
ARHGEF12Q9NZN5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
ARHGEF12Q9NZN5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ARHGEF12Q9NZN5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ARHGEF12Q9NZN5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
ARHGEF12Q9NZN5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
ARHGEF12Q9NZN5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
ARHGEF12Q9NZN5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ARHGEF12Q9NZN5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ARHGEF12Q9NZN5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ARHGEF12Q9NZN5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
ARHGEF12Q9NZN5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
ARHGEF12Q9NZN5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
ARHGEF12Q9NZN5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
ARHGEF12Q9NZN5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ARHGEF12Q9NZN5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
ARHGEF12Q9NZN5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms