Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP1

DDX18, ATP-dependent RNA helicase DDX18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX18Q9NVP1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DDX18Q9NVP1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
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