Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV79

PCMTD2, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD2Q9NV79 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCMTD2Q9NV79 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCMTD2Q9NV79 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCMTD2Q9NV79 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCMTD2Q9NV79 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCMTD2Q9NV79 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PCMTD2Q9NV79 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PCMTD2Q9NV79 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCMTD2Q9NV79 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCMTD2Q9NV79 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCMTD2Q9NV79 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCMTD2Q9NV79 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCMTD2Q9NV79 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCMTD2Q9NV79 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCMTD2Q9NV79 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PCMTD2Q9NV79 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCMTD2Q9NV79 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCMTD2Q9NV79 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCMTD2Q9NV79 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCMTD2Q9NV79 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCMTD2Q9NV79 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCMTD2Q9NV79 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PCMTD2Q9NV79 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PCMTD2Q9NV79 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCMTD2Q9NV79 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCMTD2Q9NV79 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCMTD2Q9NV79 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCMTD2Q9NV79 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCMTD2Q9NV79 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCMTD2Q9NV79 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PCMTD2Q9NV79 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCMTD2Q9NV79 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCMTD2Q9NV79 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms