Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPTLC3Q9NUV7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SPTLC3Q9NUV7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SPTLC3Q9NUV7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPTLC3Q9NUV7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPTLC3Q9NUV7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPTLC3Q9NUV7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPTLC3Q9NUV7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SPTLC3Q9NUV7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPTLC3Q9NUV7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPTLC3Q9NUV7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPTLC3Q9NUV7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPTLC3Q9NUV7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPTLC3Q9NUV7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPTLC3Q9NUV7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPTLC3Q9NUV7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPTLC3Q9NUV7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPTLC3Q9NUV7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPTLC3Q9NUV7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPTLC3Q9NUV7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPTLC3Q9NUV7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPTLC3Q9NUV7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPTLC3Q9NUV7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPTLC3Q9NUV7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPTLC3Q9NUV7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPTLC3Q9NUV7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPTLC3Q9NUV7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPTLC3Q9NUV7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPTLC3Q9NUV7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPTLC3Q9NUV7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPTLC3Q9NUV7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPTLC3Q9NUV7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPTLC3Q9NUV7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPTLC3Q9NUV7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPTLC3Q9NUV7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPTLC3Q9NUV7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPTLC3Q9NUV7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPTLC3Q9NUV7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPTLC3Q9NUV7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPTLC3Q9NUV7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPTLC3Q9NUV7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SPTLC3Q9NUV7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPTLC3Q9NUV7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPTLC3Q9NUV7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPTLC3Q9NUV7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPTLC3Q9NUV7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPTLC3Q9NUV7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms