Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT82Q9NSB4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT82Q9NSB4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT82Q9NSB4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT82Q9NSB4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT82Q9NSB4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT82Q9NSB4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT82Q9NSB4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT82Q9NSB4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT82Q9NSB4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT82Q9NSB4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT82Q9NSB4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT82Q9NSB4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT82Q9NSB4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT82Q9NSB4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT82Q9NSB4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT82Q9NSB4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT82Q9NSB4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT82Q9NSB4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT82Q9NSB4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT82Q9NSB4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT82Q9NSB4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT82Q9NSB4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT82Q9NSB4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT82Q9NSB4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT82Q9NSB4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT82Q9NSB4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT82Q9NSB4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT82Q9NSB4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT82Q9NSB4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT82Q9NSB4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT82Q9NSB4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT82Q9NSB4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT82Q9NSB4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT82Q9NSB4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT82Q9NSB4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT82Q9NSB4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT82Q9NSB4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT82Q9NSB4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT82Q9NSB4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms