Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW3

APOBEC3C, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3C, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3CQ9NRW3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.989e-7■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5B-210ENST00000552959 1085 ntTSL 320.84■□□□□ 0.931e-15■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5B-211ENST00000553007 814 ntTSL 520.58■□□□□ 0.891e-15■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5B-207ENST00000551020 856 ntTSL 320.58■□□□□ 0.891e-15■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFS8-213ENST00000531282 536 ntTSL 220.43■□□□□ 0.864e-10■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 COX7A2L-205ENST00000464443 895 ntTSL 320.24■□□□□ 0.839e-7■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 TNNT1-217ENST00000593194 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 220.15■□□□□ 0.821e-8■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.761e-8■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 KHDRBS1-203ENST00000484270 1989 ntTSL 519.63■□□□□ 0.734e-6■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.661e-8■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.659e-7■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 KHDRBS1-201ENST00000307714 2738 ntTSL 1 (best)18.71■□□□□ 0.594e-6■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.551e-8■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.451e-8■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 TNNT1-207ENST00000587089 880 ntTSL 517.77■□□□□ 0.441e-8■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.441e-8■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 VAPA-204ENST00000577901 917 ntTSL 217.61■□□□□ 0.414e-10■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5B-205ENST00000548647 682 ntTSL 517.43■□□□□ 0.381e-15■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.274e-10■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 VAPA-209ENST00000585042 567 ntTSL 416.67■□□□□ 0.264e-10■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPL13-210ENST00000562879 958 ntTSL 1 (best)16.65■□□□□ 0.261e-8■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 TNNT1-214ENST00000589745 529 ntTSL 216.5■□□□□ 0.231e-8■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.231e-8■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21e-8■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPL13-207ENST00000484610 924 ntTSL 516.29■□□□□ 0.21e-8■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPL13-211ENST00000563270 554 ntTSL 416.07■□□□□ 0.161e-8■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.151e-8■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.081e-8■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.029e-7■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 01e-8■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 TNNT1-216ENST00000593046 800 ntTSL 214.88□□□□□ -0.031e-8■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.091e-8■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.189e-7■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPL13-215ENST00000570149 435 ntTSL 213.64□□□□□ -0.231e-8■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.244e-6■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 DAP3-203ENST00000421487 1470 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.259e-7■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 PDE3A-202ENST00000542675 685 ntTSL 313.15□□□□□ -0.39e-7■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 DAP3-225ENST00000535183 1894 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.329e-7■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 DAP3-221ENST00000491777 556 ntTSL 312.58□□□□□ -0.49e-7■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 COX7A2L-202ENST00000378669 3056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.419e-7■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPL13-201ENST00000311528 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.471e-8■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 DAP3-202ENST00000368336 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.499e-7■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPL13-206ENST00000472354 631 ntTSL 311.93□□□□□ -0.51e-8■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 MYL4-207ENST00000572303 544 ntTSL 311.78□□□□□ -0.529e-7■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 COX7A2L-207ENST00000482463 1918 ntTSL 211.35□□□□□ -0.599e-7■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 ZFAS1-210ENST00000623640 732 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.774e-10■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 COX7A2L-208ENST00000607768 614 ntTSL 310.26□□□□□ -0.779e-7■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 DAP3-217ENST00000477394 816 ntTSL 510□□□□□ -0.819e-7■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 PSMA4-216ENST00000559948 710 ntTSL 59.74□□□□□ -0.854e-10■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 COX7A2L-206ENST00000468711 516 ntTSL 39.69□□□□□ -0.869e-7■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 TNNT1-206ENST00000586649 340 ntTSL 59.21□□□□□ -0.941e-8■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 PSMA4-213ENST00000559437 756 ntTSL 58.82□□□□□ -14e-10■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 PSMA4-210ENST00000559146 674 ntTSL 28.81□□□□□ -14e-10■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 ZFAS1-209ENST00000620594 508 ntTSL 38.54□□□□□ -1.044e-10■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 ZFAS1-201ENST00000326677 504 ntTSL 1 (best)8.11□□□□□ -1.114e-10■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 ZFAS1-204ENST00000428008 566 ntTSL 28.11□□□□□ -1.114e-10■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 ACSM3-207ENST00000562251 1931 ntTSL 27.35□□□□□ -1.231e-6■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 ACSM3-211ENST00000567387 843 ntTSL 37.16□□□□□ -1.261e-6■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 PSMA4-203ENST00000557929 635 ntTSL 57.15□□□□□ -1.264e-10■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 PSMA4-211ENST00000559154 637 ntTSL 25.11□□□□□ -1.594e-10■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 DAP3-207ENST00000463295 607 ntTSL 54.9□□□□□ -1.639e-7■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 DAP3-215ENST00000475056 682 ntTSL 34.9□□□□□ -1.639e-7■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.721e-6■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 DAP3-220ENST00000490249 710 ntTSL 33.24□□□□□ -1.899e-7■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 SKP1-201ENST00000328392 572 ntTSL 53.02□□□□□ -1.931e-8■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 DAP3-216ENST00000476444 679 ntTSL 22.98□□□□□ -1.939e-7■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 SKP1-205ENST00000519054 654 ntTSL 32.72□□□□□ -1.971e-8■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 VAPA-208ENST00000584796 654 ntTSL 32.24□□□□□ -2.054e-10■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 PSMA4-214ENST00000559906 583 ntTSL 22.01□□□□□ -2.094e-10■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.154e-10■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 SOD1-203ENST00000470944 1746 ntTSL 230.65■■■□□ 2.55e-10■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.295e-10■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 SOD1-202ENST00000389995 865 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.35e-10■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.051e-11■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.11e-11■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.461e-11■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPL15-210ENST00000456530 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.551e-11■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPL15-204ENST00000413699 2053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.551e-11■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.027e-8■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.367e-8■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 UBE2D3-209ENST00000394804 4166 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.67e-8■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 UBE2D3-208ENST00000394803 2227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.877e-8■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 UBE2D3-203ENST00000343106 2389 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.97e-8■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 UBE2D3-224ENST00000508474 4819 ntTSL 26.92□□□□□ -1.37e-8■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.767e-8■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 TMEM258-202ENST00000535042 921 ntTSL 314.1□□□□□ -0.153e-7■□□□□ 11.2
APOBEC3CQ9NRW3 RPL18A-207ENST00000602216 907 ntTSL 218.46■□□□□ 0.553e-9■□□□□ 11.2
APOBEC3CQ9NRW3 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.273e-9■□□□□ 11.2
APOBEC3CQ9NRW3 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.033e-9■□□□□ 11.2
APOBEC3CQ9NRW3 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.013e-9■□□□□ 11.2
APOBEC3CQ9NRW3 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.073e-6■□□□□ 11.2
APOBEC3CQ9NRW3 TMBIM6-227ENST00000552699 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.493e-6■□□□□ 11.2
APOBEC3CQ9NRW3 TMBIM6-225ENST00000552370 882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.953e-6■□□□□ 11.2
APOBEC3CQ9NRW3 TMBIM6-209ENST00000547798 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.293e-6■□□□□ 11.2
APOBEC3CQ9NRW3 TMBIM6-202ENST00000395006 2598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.293e-6■□□□□ 11.2
APOBEC3CQ9NRW3 TMBIM6-207ENST00000547013 428 ntTSL 26.09□□□□□ -1.433e-6■□□□□ 11.2
APOBEC3CQ9NRW3 SLC38A2-201ENST00000256689 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.985e-8■□□□□ 11.2
APOBEC3CQ9NRW3 SLC38A2-208ENST00000549258 4384 ntTSL 23.98□□□□□ -1.775e-8■□□□□ 11.2
APOBEC3CQ9NRW3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.591e-7■□□□□ 11.2
APOBEC3CQ9NRW3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.271e-7■□□□□ 11.2
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