Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms