Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TIMMDC1Q9NPL8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms