Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI0

TMEM138, Transmembrane protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM138Q9NPI0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM138Q9NPI0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM138Q9NPI0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms