Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CLSPNQ9HAW4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CLSPNQ9HAW4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CLSPNQ9HAW4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CLSPNQ9HAW4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CLSPNQ9HAW4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CLSPNQ9HAW4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
CLSPNQ9HAW4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CLSPNQ9HAW4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CLSPNQ9HAW4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CLSPNQ9HAW4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CLSPNQ9HAW4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CLSPNQ9HAW4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CLSPNQ9HAW4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CLSPNQ9HAW4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CLSPNQ9HAW4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CLSPNQ9HAW4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CLSPNQ9HAW4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CLSPNQ9HAW4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CLSPNQ9HAW4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CLSPNQ9HAW4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CLSPNQ9HAW4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CLSPNQ9HAW4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
CLSPNQ9HAW4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CLSPNQ9HAW4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CLSPNQ9HAW4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CLSPNQ9HAW4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CLSPNQ9HAW4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CLSPNQ9HAW4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CLSPNQ9HAW4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CLSPNQ9HAW4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CLSPNQ9HAW4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CLSPNQ9HAW4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CLSPNQ9HAW4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CLSPNQ9HAW4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CLSPNQ9HAW4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CLSPNQ9HAW4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CLSPNQ9HAW4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CLSPNQ9HAW4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CLSPNQ9HAW4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CLSPNQ9HAW4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CLSPNQ9HAW4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CLSPNQ9HAW4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CLSPNQ9HAW4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
CLSPNQ9HAW4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CLSPNQ9HAW4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CLSPNQ9HAW4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
CLSPNQ9HAW4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
CLSPNQ9HAW4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.93
CLSPNQ9HAW4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.93
CLSPNQ9HAW4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.93
CLSPNQ9HAW4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
CLSPNQ9HAW4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CLSPNQ9HAW4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CLSPNQ9HAW4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CLSPNQ9HAW4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CLSPNQ9HAW4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CLSPNQ9HAW4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CLSPNQ9HAW4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CLSPNQ9HAW4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CLSPNQ9HAW4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CLSPNQ9HAW4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CLSPNQ9HAW4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CLSPNQ9HAW4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
CLSPNQ9HAW4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CLSPNQ9HAW4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CLSPNQ9HAW4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CLSPNQ9HAW4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CLSPNQ9HAW4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CLSPNQ9HAW4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CLSPNQ9HAW4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CLSPNQ9HAW4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CLSPNQ9HAW4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CLSPNQ9HAW4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CLSPNQ9HAW4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
CLSPNQ9HAW4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CLSPNQ9HAW4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CLSPNQ9HAW4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CLSPNQ9HAW4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CLSPNQ9HAW4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CLSPNQ9HAW4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CLSPNQ9HAW4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CLSPNQ9HAW4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CLSPNQ9HAW4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CLSPNQ9HAW4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CLSPNQ9HAW4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CLSPNQ9HAW4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CLSPNQ9HAW4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CLSPNQ9HAW4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CLSPNQ9HAW4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CLSPNQ9HAW4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CLSPNQ9HAW4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CLSPNQ9HAW4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CLSPNQ9HAW4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CLSPNQ9HAW4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CLSPNQ9HAW4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CLSPNQ9HAW4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CLSPNQ9HAW4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CLSPNQ9HAW4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CLSPNQ9HAW4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms