Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E9

C8orf33, UPF0488 protein C8orf33, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf33Q9H7E9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C8orf33Q9H7E9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C8orf33Q9H7E9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C8orf33Q9H7E9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C8orf33Q9H7E9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C8orf33Q9H7E9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C8orf33Q9H7E9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C8orf33Q9H7E9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C8orf33Q9H7E9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C8orf33Q9H7E9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C8orf33Q9H7E9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C8orf33Q9H7E9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C8orf33Q9H7E9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C8orf33Q9H7E9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C8orf33Q9H7E9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C8orf33Q9H7E9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
C8orf33Q9H7E9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C8orf33Q9H7E9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms