Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNMDQ9H2S6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TNMDQ9H2S6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms