Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR8

KRTAP3-1, Keratin-associated protein 3-1, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP3-1Q9BYR8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms