Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXB1

LGR4, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR4Q9BXB1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms