Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRIP1Q9BX63 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRIP1Q9BX63 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRIP1Q9BX63 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRIP1Q9BX63 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRIP1Q9BX63 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRIP1Q9BX63 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRIP1Q9BX63 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
BRIP1Q9BX63 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRIP1Q9BX63 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRIP1Q9BX63 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRIP1Q9BX63 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRIP1Q9BX63 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRIP1Q9BX63 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRIP1Q9BX63 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRIP1Q9BX63 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRIP1Q9BX63 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRIP1Q9BX63 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRIP1Q9BX63 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRIP1Q9BX63 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRIP1Q9BX63 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRIP1Q9BX63 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRIP1Q9BX63 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRIP1Q9BX63 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRIP1Q9BX63 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRIP1Q9BX63 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRIP1Q9BX63 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRIP1Q9BX63 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRIP1Q9BX63 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRIP1Q9BX63 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRIP1Q9BX63 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
BRIP1Q9BX63 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRIP1Q9BX63 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRIP1Q9BX63 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRIP1Q9BX63 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRIP1Q9BX63 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRIP1Q9BX63 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRIP1Q9BX63 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
BRIP1Q9BX63 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRIP1Q9BX63 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRIP1Q9BX63 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRIP1Q9BX63 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRIP1Q9BX63 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
BRIP1Q9BX63 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BRIP1Q9BX63 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BRIP1Q9BX63 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
BRIP1Q9BX63 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BRIP1Q9BX63 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BRIP1Q9BX63 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BRIP1Q9BX63 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BRIP1Q9BX63 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BRIP1Q9BX63 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BRIP1Q9BX63 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BRIP1Q9BX63 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
BRIP1Q9BX63 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRIP1Q9BX63 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRIP1Q9BX63 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
BRIP1Q9BX63 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
BRIP1Q9BX63 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRIP1Q9BX63 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRIP1Q9BX63 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRIP1Q9BX63 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRIP1Q9BX63 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRIP1Q9BX63 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRIP1Q9BX63 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRIP1Q9BX63 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRIP1Q9BX63 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
BRIP1Q9BX63 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRIP1Q9BX63 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRIP1Q9BX63 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRIP1Q9BX63 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRIP1Q9BX63 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRIP1Q9BX63 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRIP1Q9BX63 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRIP1Q9BX63 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRIP1Q9BX63 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRIP1Q9BX63 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRIP1Q9BX63 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BRIP1Q9BX63 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BRIP1Q9BX63 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BRIP1Q9BX63 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BRIP1Q9BX63 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BRIP1Q9BX63 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BRIP1Q9BX63 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRIP1Q9BX63 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRIP1Q9BX63 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
BRIP1Q9BX63 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRIP1Q9BX63 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
BRIP1Q9BX63 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRIP1Q9BX63 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRIP1Q9BX63 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRIP1Q9BX63 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
BRIP1Q9BX63 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
BRIP1Q9BX63 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
BRIP1Q9BX63 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms