Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
THUMPD2Q9BTF0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
THUMPD2Q9BTF0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
THUMPD2Q9BTF0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
THUMPD2Q9BTF0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
THUMPD2Q9BTF0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
THUMPD2Q9BTF0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
THUMPD2Q9BTF0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
THUMPD2Q9BTF0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
THUMPD2Q9BTF0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
THUMPD2Q9BTF0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
THUMPD2Q9BTF0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
THUMPD2Q9BTF0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
THUMPD2Q9BTF0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
THUMPD2Q9BTF0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
THUMPD2Q9BTF0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
THUMPD2Q9BTF0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
THUMPD2Q9BTF0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
THUMPD2Q9BTF0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
THUMPD2Q9BTF0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
THUMPD2Q9BTF0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
THUMPD2Q9BTF0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
THUMPD2Q9BTF0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
THUMPD2Q9BTF0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
THUMPD2Q9BTF0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
THUMPD2Q9BTF0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
THUMPD2Q9BTF0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
THUMPD2Q9BTF0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
THUMPD2Q9BTF0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
THUMPD2Q9BTF0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
THUMPD2Q9BTF0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
THUMPD2Q9BTF0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
THUMPD2Q9BTF0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
THUMPD2Q9BTF0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
THUMPD2Q9BTF0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
THUMPD2Q9BTF0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
THUMPD2Q9BTF0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
THUMPD2Q9BTF0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
THUMPD2Q9BTF0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
THUMPD2Q9BTF0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
THUMPD2Q9BTF0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
THUMPD2Q9BTF0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
THUMPD2Q9BTF0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
THUMPD2Q9BTF0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
THUMPD2Q9BTF0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
THUMPD2Q9BTF0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
THUMPD2Q9BTF0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
THUMPD2Q9BTF0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
THUMPD2Q9BTF0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
THUMPD2Q9BTF0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
THUMPD2Q9BTF0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
THUMPD2Q9BTF0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
THUMPD2Q9BTF0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
THUMPD2Q9BTF0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
THUMPD2Q9BTF0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
THUMPD2Q9BTF0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
THUMPD2Q9BTF0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
THUMPD2Q9BTF0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
THUMPD2Q9BTF0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
THUMPD2Q9BTF0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
THUMPD2Q9BTF0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
THUMPD2Q9BTF0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
THUMPD2Q9BTF0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
THUMPD2Q9BTF0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
THUMPD2Q9BTF0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
THUMPD2Q9BTF0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
THUMPD2Q9BTF0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
THUMPD2Q9BTF0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
THUMPD2Q9BTF0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
THUMPD2Q9BTF0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
THUMPD2Q9BTF0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
THUMPD2Q9BTF0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
THUMPD2Q9BTF0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
THUMPD2Q9BTF0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
THUMPD2Q9BTF0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
THUMPD2Q9BTF0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
THUMPD2Q9BTF0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
THUMPD2Q9BTF0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
THUMPD2Q9BTF0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
THUMPD2Q9BTF0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
THUMPD2Q9BTF0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
THUMPD2Q9BTF0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
THUMPD2Q9BTF0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
THUMPD2Q9BTF0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
THUMPD2Q9BTF0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
THUMPD2Q9BTF0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
THUMPD2Q9BTF0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
THUMPD2Q9BTF0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
THUMPD2Q9BTF0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
THUMPD2Q9BTF0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
THUMPD2Q9BTF0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
THUMPD2Q9BTF0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
THUMPD2Q9BTF0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
THUMPD2Q9BTF0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
THUMPD2Q9BTF0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
THUMPD2Q9BTF0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
THUMPD2Q9BTF0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
THUMPD2Q9BTF0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
THUMPD2Q9BTF0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
THUMPD2Q9BTF0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms