Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSK4

FEM1A, Protein fem-1 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FEM1AQ9BSK4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FEM1AQ9BSK4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FEM1AQ9BSK4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FEM1AQ9BSK4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FEM1AQ9BSK4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FEM1AQ9BSK4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FEM1AQ9BSK4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FEM1AQ9BSK4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FEM1AQ9BSK4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FEM1AQ9BSK4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FEM1AQ9BSK4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FEM1AQ9BSK4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
FEM1AQ9BSK4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FEM1AQ9BSK4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FEM1AQ9BSK4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FEM1AQ9BSK4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FEM1AQ9BSK4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FEM1AQ9BSK4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FEM1AQ9BSK4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FEM1AQ9BSK4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FEM1AQ9BSK4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FEM1AQ9BSK4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FEM1AQ9BSK4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FEM1AQ9BSK4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FEM1AQ9BSK4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FEM1AQ9BSK4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FEM1AQ9BSK4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FEM1AQ9BSK4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FEM1AQ9BSK4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FEM1AQ9BSK4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FEM1AQ9BSK4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FEM1AQ9BSK4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FEM1AQ9BSK4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FEM1AQ9BSK4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FEM1AQ9BSK4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FEM1AQ9BSK4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FEM1AQ9BSK4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FEM1AQ9BSK4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FEM1AQ9BSK4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FEM1AQ9BSK4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FEM1AQ9BSK4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FEM1AQ9BSK4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FEM1AQ9BSK4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FEM1AQ9BSK4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FEM1AQ9BSK4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FEM1AQ9BSK4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FEM1AQ9BSK4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FEM1AQ9BSK4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FEM1AQ9BSK4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FEM1AQ9BSK4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FEM1AQ9BSK4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FEM1AQ9BSK4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FEM1AQ9BSK4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FEM1AQ9BSK4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FEM1AQ9BSK4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FEM1AQ9BSK4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FEM1AQ9BSK4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FEM1AQ9BSK4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FEM1AQ9BSK4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FEM1AQ9BSK4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FEM1AQ9BSK4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FEM1AQ9BSK4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FEM1AQ9BSK4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FEM1AQ9BSK4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FEM1AQ9BSK4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FEM1AQ9BSK4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FEM1AQ9BSK4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FEM1AQ9BSK4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FEM1AQ9BSK4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FEM1AQ9BSK4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FEM1AQ9BSK4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FEM1AQ9BSK4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FEM1AQ9BSK4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FEM1AQ9BSK4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FEM1AQ9BSK4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FEM1AQ9BSK4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FEM1AQ9BSK4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FEM1AQ9BSK4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FEM1AQ9BSK4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FEM1AQ9BSK4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FEM1AQ9BSK4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FEM1AQ9BSK4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FEM1AQ9BSK4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FEM1AQ9BSK4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FEM1AQ9BSK4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FEM1AQ9BSK4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FEM1AQ9BSK4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FEM1AQ9BSK4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FEM1AQ9BSK4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FEM1AQ9BSK4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FEM1AQ9BSK4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FEM1AQ9BSK4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FEM1AQ9BSK4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FEM1AQ9BSK4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FEM1AQ9BSK4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FEM1AQ9BSK4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FEM1AQ9BSK4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FEM1AQ9BSK4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FEM1AQ9BSK4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FEM1AQ9BSK4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms