Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms