Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms