Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
POP1Q99575 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POP1Q99575 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POP1Q99575 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POP1Q99575 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POP1Q99575 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POP1Q99575 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POP1Q99575 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POP1Q99575 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POP1Q99575 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POP1Q99575 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POP1Q99575 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POP1Q99575 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POP1Q99575 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POP1Q99575 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POP1Q99575 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POP1Q99575 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POP1Q99575 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POP1Q99575 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POP1Q99575 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POP1Q99575 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POP1Q99575 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POP1Q99575 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POP1Q99575 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
POP1Q99575 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POP1Q99575 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POP1Q99575 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POP1Q99575 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POP1Q99575 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POP1Q99575 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POP1Q99575 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
POP1Q99575 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POP1Q99575 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25■■□□□ 1.59
POP1Q99575 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POP1Q99575 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25■■□□□ 1.59
POP1Q99575 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POP1Q99575 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
POP1Q99575 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POP1Q99575 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POP1Q99575 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POP1Q99575 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POP1Q99575 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POP1Q99575 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POP1Q99575 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POP1Q99575 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POP1Q99575 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POP1Q99575 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POP1Q99575 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POP1Q99575 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POP1Q99575 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POP1Q99575 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POP1Q99575 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POP1Q99575 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POP1Q99575 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POP1Q99575 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POP1Q99575 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POP1Q99575 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POP1Q99575 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POP1Q99575 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POP1Q99575 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POP1Q99575 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POP1Q99575 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POP1Q99575 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POP1Q99575 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POP1Q99575 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POP1Q99575 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POP1Q99575 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POP1Q99575 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POP1Q99575 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POP1Q99575 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
POP1Q99575 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POP1Q99575 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POP1Q99575 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POP1Q99575 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POP1Q99575 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POP1Q99575 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POP1Q99575 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
POP1Q99575 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POP1Q99575 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POP1Q99575 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POP1Q99575 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POP1Q99575 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POP1Q99575 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POP1Q99575 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POP1Q99575 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
POP1Q99575 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POP1Q99575 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POP1Q99575 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POP1Q99575 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POP1Q99575 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POP1Q99575 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POP1Q99575 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POP1Q99575 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POP1Q99575 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POP1Q99575 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POP1Q99575 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POP1Q99575 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POP1Q99575 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POP1Q99575 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POP1Q99575 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms