Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHOX2BQ99453 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms