Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV4

PNMA5, Paraneoplastic antigen-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA5Q96PV4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PNMA5Q96PV4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PNMA5Q96PV4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PNMA5Q96PV4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PNMA5Q96PV4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PNMA5Q96PV4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PNMA5Q96PV4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PNMA5Q96PV4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PNMA5Q96PV4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PNMA5Q96PV4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNMA5Q96PV4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNMA5Q96PV4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNMA5Q96PV4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNMA5Q96PV4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNMA5Q96PV4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNMA5Q96PV4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNMA5Q96PV4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNMA5Q96PV4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNMA5Q96PV4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNMA5Q96PV4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNMA5Q96PV4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNMA5Q96PV4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PNMA5Q96PV4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNMA5Q96PV4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNMA5Q96PV4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNMA5Q96PV4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNMA5Q96PV4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNMA5Q96PV4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNMA5Q96PV4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNMA5Q96PV4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PNMA5Q96PV4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PNMA5Q96PV4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PNMA5Q96PV4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PNMA5Q96PV4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PNMA5Q96PV4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PNMA5Q96PV4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNMA5Q96PV4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNMA5Q96PV4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNMA5Q96PV4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNMA5Q96PV4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PNMA5Q96PV4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNMA5Q96PV4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA5Q96PV4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA5Q96PV4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA5Q96PV4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA5Q96PV4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms