Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE6

ZIM3, Zinc finger imprinted 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIM3Q96PE6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZIM3Q96PE6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms