Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC114Q96M63 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC114Q96M63 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC114Q96M63 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC114Q96M63 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC114Q96M63 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC114Q96M63 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC114Q96M63 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC114Q96M63 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC114Q96M63 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC114Q96M63 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC114Q96M63 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC114Q96M63 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC114Q96M63 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC114Q96M63 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC114Q96M63 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC114Q96M63 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC114Q96M63 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC114Q96M63 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC114Q96M63 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC114Q96M63 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC114Q96M63 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC114Q96M63 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC114Q96M63 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC114Q96M63 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC114Q96M63 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC114Q96M63 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC114Q96M63 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC114Q96M63 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC114Q96M63 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC114Q96M63 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC114Q96M63 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC114Q96M63 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC114Q96M63 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC114Q96M63 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC114Q96M63 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC114Q96M63 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC114Q96M63 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC114Q96M63 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC114Q96M63 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC114Q96M63 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC114Q96M63 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC114Q96M63 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC114Q96M63 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms