Protein–RNA interactions for Protein: Q96GM5

SMARCD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD1Q96GM5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMARCD1Q96GM5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCD1Q96GM5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCD1Q96GM5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCD1Q96GM5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCD1Q96GM5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCD1Q96GM5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCD1Q96GM5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCD1Q96GM5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCD1Q96GM5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCD1Q96GM5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCD1Q96GM5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCD1Q96GM5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCD1Q96GM5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCD1Q96GM5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCD1Q96GM5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCD1Q96GM5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCD1Q96GM5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCD1Q96GM5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCD1Q96GM5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCD1Q96GM5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCD1Q96GM5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCD1Q96GM5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCD1Q96GM5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCD1Q96GM5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCD1Q96GM5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCD1Q96GM5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCD1Q96GM5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCD1Q96GM5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCD1Q96GM5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCD1Q96GM5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCD1Q96GM5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCD1Q96GM5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCD1Q96GM5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCD1Q96GM5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCD1Q96GM5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCD1Q96GM5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCD1Q96GM5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCD1Q96GM5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCD1Q96GM5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCD1Q96GM5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCD1Q96GM5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCD1Q96GM5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCD1Q96GM5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCD1Q96GM5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCD1Q96GM5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms