Protein–RNA interactions for Protein: Q96E16

SMIM19, Small integral membrane protein 19, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM19Q96E16 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM19Q96E16 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms