Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
TRIM44Q96DX7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIM44Q96DX7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms