Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRAMD1AQ96CP6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.5 ms