Protein–RNA interactions for Protein: Q92989

CLP1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLP1Q92989 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLP1Q92989 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLP1Q92989 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLP1Q92989 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLP1Q92989 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLP1Q92989 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLP1Q92989 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLP1Q92989 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLP1Q92989 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLP1Q92989 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLP1Q92989 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLP1Q92989 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLP1Q92989 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLP1Q92989 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLP1Q92989 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLP1Q92989 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLP1Q92989 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLP1Q92989 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLP1Q92989 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLP1Q92989 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLP1Q92989 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLP1Q92989 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLP1Q92989 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLP1Q92989 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLP1Q92989 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CLP1Q92989 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLP1Q92989 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLP1Q92989 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLP1Q92989 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLP1Q92989 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CLP1Q92989 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLP1Q92989 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CLP1Q92989 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CLP1Q92989 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CLP1Q92989 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLP1Q92989 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CLP1Q92989 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLP1Q92989 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLP1Q92989 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLP1Q92989 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms