Protein–RNA interactions for Protein: Q92529

SHC3, SHC-transforming protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC3Q92529 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHC3Q92529 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SHC3Q92529 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SHC3Q92529 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SHC3Q92529 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHC3Q92529 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SHC3Q92529 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHC3Q92529 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHC3Q92529 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHC3Q92529 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHC3Q92529 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHC3Q92529 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHC3Q92529 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SHC3Q92529 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHC3Q92529 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHC3Q92529 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHC3Q92529 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHC3Q92529 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHC3Q92529 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHC3Q92529 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHC3Q92529 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHC3Q92529 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHC3Q92529 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHC3Q92529 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHC3Q92529 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHC3Q92529 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHC3Q92529 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHC3Q92529 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHC3Q92529 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHC3Q92529 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHC3Q92529 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms