Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEE9

SAP25, Histone deacetylase complex subunit SAP25, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAP25Q8TEE9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAP25Q8TEE9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAP25Q8TEE9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAP25Q8TEE9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAP25Q8TEE9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAP25Q8TEE9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAP25Q8TEE9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAP25Q8TEE9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAP25Q8TEE9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAP25Q8TEE9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAP25Q8TEE9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAP25Q8TEE9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAP25Q8TEE9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAP25Q8TEE9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAP25Q8TEE9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAP25Q8TEE9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAP25Q8TEE9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAP25Q8TEE9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAP25Q8TEE9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAP25Q8TEE9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAP25Q8TEE9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAP25Q8TEE9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAP25Q8TEE9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAP25Q8TEE9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAP25Q8TEE9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAP25Q8TEE9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SAP25Q8TEE9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms