Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC71

SPATA18, Mitochondria-eating protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA18Q8TC71 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPATA18Q8TC71 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPATA18Q8TC71 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPATA18Q8TC71 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPATA18Q8TC71 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPATA18Q8TC71 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPATA18Q8TC71 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPATA18Q8TC71 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPATA18Q8TC71 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPATA18Q8TC71 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPATA18Q8TC71 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPATA18Q8TC71 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPATA18Q8TC71 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPATA18Q8TC71 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPATA18Q8TC71 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SPATA18Q8TC71 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPATA18Q8TC71 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPATA18Q8TC71 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPATA18Q8TC71 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPATA18Q8TC71 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPATA18Q8TC71 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPATA18Q8TC71 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPATA18Q8TC71 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPATA18Q8TC71 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPATA18Q8TC71 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPATA18Q8TC71 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPATA18Q8TC71 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPATA18Q8TC71 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPATA18Q8TC71 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPATA18Q8TC71 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPATA18Q8TC71 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPATA18Q8TC71 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPATA18Q8TC71 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SPATA18Q8TC71 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SPATA18Q8TC71 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPATA18Q8TC71 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPATA18Q8TC71 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SPATA18Q8TC71 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SPATA18Q8TC71 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPATA18Q8TC71 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPATA18Q8TC71 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPATA18Q8TC71 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPATA18Q8TC71 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SPATA18Q8TC71 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPATA18Q8TC71 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPATA18Q8TC71 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPATA18Q8TC71 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SPATA18Q8TC71 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPATA18Q8TC71 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPATA18Q8TC71 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPATA18Q8TC71 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPATA18Q8TC71 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPATA18Q8TC71 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPATA18Q8TC71 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPATA18Q8TC71 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPATA18Q8TC71 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPATA18Q8TC71 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPATA18Q8TC71 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPATA18Q8TC71 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPATA18Q8TC71 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPATA18Q8TC71 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPATA18Q8TC71 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPATA18Q8TC71 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPATA18Q8TC71 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPATA18Q8TC71 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPATA18Q8TC71 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPATA18Q8TC71 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPATA18Q8TC71 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPATA18Q8TC71 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPATA18Q8TC71 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPATA18Q8TC71 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPATA18Q8TC71 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPATA18Q8TC71 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPATA18Q8TC71 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPATA18Q8TC71 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPATA18Q8TC71 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPATA18Q8TC71 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPATA18Q8TC71 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPATA18Q8TC71 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPATA18Q8TC71 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPATA18Q8TC71 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPATA18Q8TC71 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPATA18Q8TC71 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPATA18Q8TC71 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPATA18Q8TC71 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPATA18Q8TC71 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPATA18Q8TC71 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPATA18Q8TC71 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPATA18Q8TC71 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPATA18Q8TC71 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPATA18Q8TC71 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPATA18Q8TC71 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPATA18Q8TC71 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPATA18Q8TC71 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPATA18Q8TC71 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPATA18Q8TC71 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPATA18Q8TC71 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPATA18Q8TC71 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPATA18Q8TC71 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPATA18Q8TC71 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms