Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC56

FAM71B, Protein FAM71B, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71BQ8TC56 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms