Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KLHDC4Q8TBB5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KLHDC4Q8TBB5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KLHDC4Q8TBB5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KLHDC4Q8TBB5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KLHDC4Q8TBB5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KLHDC4Q8TBB5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KLHDC4Q8TBB5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KLHDC4Q8TBB5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KLHDC4Q8TBB5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KLHDC4Q8TBB5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KLHDC4Q8TBB5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KLHDC4Q8TBB5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KLHDC4Q8TBB5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KLHDC4Q8TBB5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KLHDC4Q8TBB5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KLHDC4Q8TBB5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KLHDC4Q8TBB5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KLHDC4Q8TBB5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KLHDC4Q8TBB5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KLHDC4Q8TBB5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KLHDC4Q8TBB5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
KLHDC4Q8TBB5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KLHDC4Q8TBB5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KLHDC4Q8TBB5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KLHDC4Q8TBB5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KLHDC4Q8TBB5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KLHDC4Q8TBB5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KLHDC4Q8TBB5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KLHDC4Q8TBB5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KLHDC4Q8TBB5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KLHDC4Q8TBB5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KLHDC4Q8TBB5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KLHDC4Q8TBB5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KLHDC4Q8TBB5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
KLHDC4Q8TBB5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KLHDC4Q8TBB5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KLHDC4Q8TBB5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KLHDC4Q8TBB5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KLHDC4Q8TBB5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KLHDC4Q8TBB5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
KLHDC4Q8TBB5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
KLHDC4Q8TBB5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KLHDC4Q8TBB5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KLHDC4Q8TBB5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
KLHDC4Q8TBB5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KLHDC4Q8TBB5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
KLHDC4Q8TBB5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KLHDC4Q8TBB5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KLHDC4Q8TBB5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KLHDC4Q8TBB5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
KLHDC4Q8TBB5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KLHDC4Q8TBB5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KLHDC4Q8TBB5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KLHDC4Q8TBB5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KLHDC4Q8TBB5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
KLHDC4Q8TBB5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KLHDC4Q8TBB5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KLHDC4Q8TBB5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KLHDC4Q8TBB5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KLHDC4Q8TBB5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KLHDC4Q8TBB5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KLHDC4Q8TBB5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KLHDC4Q8TBB5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KLHDC4Q8TBB5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KLHDC4Q8TBB5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KLHDC4Q8TBB5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KLHDC4Q8TBB5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KLHDC4Q8TBB5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KLHDC4Q8TBB5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KLHDC4Q8TBB5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KLHDC4Q8TBB5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KLHDC4Q8TBB5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KLHDC4Q8TBB5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KLHDC4Q8TBB5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KLHDC4Q8TBB5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KLHDC4Q8TBB5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
KLHDC4Q8TBB5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KLHDC4Q8TBB5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KLHDC4Q8TBB5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KLHDC4Q8TBB5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KLHDC4Q8TBB5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KLHDC4Q8TBB5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KLHDC4Q8TBB5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KLHDC4Q8TBB5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KLHDC4Q8TBB5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KLHDC4Q8TBB5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KLHDC4Q8TBB5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KLHDC4Q8TBB5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KLHDC4Q8TBB5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KLHDC4Q8TBB5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KLHDC4Q8TBB5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
KLHDC4Q8TBB5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KLHDC4Q8TBB5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KLHDC4Q8TBB5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KLHDC4Q8TBB5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KLHDC4Q8TBB5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KLHDC4Q8TBB5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KLHDC4Q8TBB5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KLHDC4Q8TBB5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms