Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG8

ZNRF2, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF2, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF2Q8NHG8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ZNRF2Q8NHG8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNRF2Q8NHG8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNRF2Q8NHG8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNRF2Q8NHG8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNRF2Q8NHG8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNRF2Q8NHG8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNRF2Q8NHG8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNRF2Q8NHG8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNRF2Q8NHG8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNRF2Q8NHG8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNRF2Q8NHG8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNRF2Q8NHG8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNRF2Q8NHG8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNRF2Q8NHG8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNRF2Q8NHG8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNRF2Q8NHG8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNRF2Q8NHG8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNRF2Q8NHG8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNRF2Q8NHG8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNRF2Q8NHG8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNRF2Q8NHG8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNRF2Q8NHG8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNRF2Q8NHG8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNRF2Q8NHG8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNRF2Q8NHG8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNRF2Q8NHG8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms