Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ8

CADM4, Cell adhesion molecule 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM4Q8NFZ8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CADM4Q8NFZ8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CADM4Q8NFZ8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CADM4Q8NFZ8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CADM4Q8NFZ8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CADM4Q8NFZ8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CADM4Q8NFZ8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CADM4Q8NFZ8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CADM4Q8NFZ8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CADM4Q8NFZ8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CADM4Q8NFZ8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CADM4Q8NFZ8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CADM4Q8NFZ8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CADM4Q8NFZ8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CADM4Q8NFZ8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CADM4Q8NFZ8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CADM4Q8NFZ8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CADM4Q8NFZ8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CADM4Q8NFZ8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CADM4Q8NFZ8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CADM4Q8NFZ8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CADM4Q8NFZ8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CADM4Q8NFZ8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CADM4Q8NFZ8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CADM4Q8NFZ8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CADM4Q8NFZ8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CADM4Q8NFZ8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CADM4Q8NFZ8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CADM4Q8NFZ8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CADM4Q8NFZ8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CADM4Q8NFZ8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CADM4Q8NFZ8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CADM4Q8NFZ8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CADM4Q8NFZ8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CADM4Q8NFZ8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms