Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BBOF1Q8ND07 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms