Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APCDD1LQ8NCL9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APCDD1LQ8NCL9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
APCDD1LQ8NCL9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APCDD1LQ8NCL9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APCDD1LQ8NCL9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
APCDD1LQ8NCL9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APCDD1LQ8NCL9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APCDD1LQ8NCL9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APCDD1LQ8NCL9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APCDD1LQ8NCL9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APCDD1LQ8NCL9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APCDD1LQ8NCL9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APCDD1LQ8NCL9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
APCDD1LQ8NCL9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
APCDD1LQ8NCL9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APCDD1LQ8NCL9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms