Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD53Q8N9V6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD53Q8N9V6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD53Q8N9V6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD53Q8N9V6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD53Q8N9V6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD53Q8N9V6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD53Q8N9V6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD53Q8N9V6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD53Q8N9V6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms