Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
AMER3Q8N944 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
AMER3Q8N944 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
AMER3Q8N944 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AMER3Q8N944 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AMER3Q8N944 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AMER3Q8N944 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AMER3Q8N944 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AMER3Q8N944 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AMER3Q8N944 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AMER3Q8N944 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AMER3Q8N944 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AMER3Q8N944 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AMER3Q8N944 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AMER3Q8N944 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
AMER3Q8N944 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms