Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHCHD4Q8N4Q1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHCHD4Q8N4Q1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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