Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCL2Q8N4E4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms