Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
VPS8Q8N3P4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
VPS8Q8N3P4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
VPS8Q8N3P4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
VPS8Q8N3P4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC36.02■■■■□ 3.36
VPS8Q8N3P4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
VPS8Q8N3P4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
VPS8Q8N3P4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
VPS8Q8N3P4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
VPS8Q8N3P4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
VPS8Q8N3P4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
VPS8Q8N3P4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
VPS8Q8N3P4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
VPS8Q8N3P4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
VPS8Q8N3P4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.35
VPS8Q8N3P4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
VPS8Q8N3P4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
VPS8Q8N3P4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
VPS8Q8N3P4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
VPS8Q8N3P4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
VPS8Q8N3P4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
VPS8Q8N3P4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
VPS8Q8N3P4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
VPS8Q8N3P4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
VPS8Q8N3P4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
VPS8Q8N3P4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
VPS8Q8N3P4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
VPS8Q8N3P4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
VPS8Q8N3P4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
VPS8Q8N3P4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
VPS8Q8N3P4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
VPS8Q8N3P4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
VPS8Q8N3P4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
VPS8Q8N3P4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
VPS8Q8N3P4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
VPS8Q8N3P4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
VPS8Q8N3P4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
VPS8Q8N3P4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.34
VPS8Q8N3P4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
VPS8Q8N3P4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
VPS8Q8N3P4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC35.94■■■■□ 3.34
VPS8Q8N3P4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
VPS8Q8N3P4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
VPS8Q8N3P4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
VPS8Q8N3P4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
VPS8Q8N3P4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
VPS8Q8N3P4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
VPS8Q8N3P4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
VPS8Q8N3P4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
VPS8Q8N3P4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
VPS8Q8N3P4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC35.92■■■■□ 3.34
VPS8Q8N3P4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
VPS8Q8N3P4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
VPS8Q8N3P4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
VPS8Q8N3P4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
VPS8Q8N3P4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
VPS8Q8N3P4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
VPS8Q8N3P4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
VPS8Q8N3P4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
VPS8Q8N3P4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
VPS8Q8N3P4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
VPS8Q8N3P4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
VPS8Q8N3P4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
VPS8Q8N3P4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
VPS8Q8N3P4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
VPS8Q8N3P4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
VPS8Q8N3P4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
VPS8Q8N3P4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
VPS8Q8N3P4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
VPS8Q8N3P4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
VPS8Q8N3P4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
VPS8Q8N3P4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
VPS8Q8N3P4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
VPS8Q8N3P4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
VPS8Q8N3P4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
VPS8Q8N3P4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
VPS8Q8N3P4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
VPS8Q8N3P4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
VPS8Q8N3P4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
VPS8Q8N3P4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
VPS8Q8N3P4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
VPS8Q8N3P4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
VPS8Q8N3P4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
VPS8Q8N3P4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
VPS8Q8N3P4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
VPS8Q8N3P4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
VPS8Q8N3P4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
VPS8Q8N3P4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
VPS8Q8N3P4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
VPS8Q8N3P4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
VPS8Q8N3P4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
VPS8Q8N3P4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
VPS8Q8N3P4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
VPS8Q8N3P4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
VPS8Q8N3P4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
VPS8Q8N3P4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
VPS8Q8N3P4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
VPS8Q8N3P4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
VPS8Q8N3P4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
VPS8Q8N3P4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms